12 - Tot ist tot
Nachdem er von Sun k.o. geschlagen wurde, erwacht Ben Linus im Lager der Überlebenden von Ajira Flug 316. Er ist zunächst überrascht, ausgerechnet John Locke an seinem Bett vorzufinden. Den hatte er vor Flugbeginn ermordet. Nachdem Ben sich wieder gefangen hat, kündigt er an, er müsse zur Hauptinsel und sich vom Rauchmonster richten lassen, da er unerlaubt auf die Insel zurückgekehrt sei.
13 - Das Imperium schlägt zurück
Miles wird von Horace Goodspeed beauftragt, eine Leiche von der Schwan-Station zu Dr. Pierre Chang zu bringen. Widerwillig kommt Miles dem nach. Er kann allerdings nicht verhindern, dass sich Hurley zu ihm in den Transporter setzt und prompt die Leiche entdeckt. Damit nicht genug: Der stets hilfsbereite Hurley ist zudem fest entschlossen, Miles mit seinem lange verschollenen Vater wiederzuvereinen, der sich ebenfalls auf der Insel befindet.
14 - Die Variable
Nach seiner Rückkehr auf die Insel kennt Daniel Faraday nur ein Ziel: Er will ein katastrophales Ereignis abwenden, das sich in sechs Stunden in der Schwan-Station abspielen wird ¿ und das nach Daniels Berechnungen die gesamte Insel verwüsten wird. DHARMA-Forscher Dr. Pierre Chang schenkt Daniels wilden Behauptungen allerdings keinen Glauben. Daniel, Jack und Kate beschließen daraufhin, sich zu den Anderen durchzuschlagen und sie vor der bevorstehenden Katastrophe zu warnen.
15 - Der Anführer
Jack und Kate sind sich uneins darüber, wie sie weiter fortfahren sollen, um ihre Gefährten auf der Insel zu retten bis sie unerwartete Unterstützung bekommen. Sie beschließen Faraday´s Plan zu vollenden und die Schwan-Station mit der Wasserstoffbombe zu sprengen, um eine weitaus größere Katastrophe zu verhindern. John Locke nutzt seinen Status als neuer Anführer "der Anderen" , um einen lange gehegten Plan in die Tat umzusetzten: Er will den mysteriösen Jacob endlich persönlich treffen...